厦门五缘第二实验学校位于厦门岛东北角的五缘湾西片区，南邻五缘内湾，西邻云顶北路，东临金山路。高档楼房环绕，生活配套设施完善，周边风景旖旎。学校用地总面积有79075.590㎡，建筑面积为40715㎡，规模宏大，建筑模仿清华风格，美轮美奂，是厦门市已建的现代精品学园。

校内采用FENSAV泛思数字广播，自动管理日常上下课打铃，课间操，眼保健操等定时节目，在操场广播站配备分控系统，用于校园广播播音，并可以在升旗仪式或校运会等活动进行讲话。